靈活就業社保和職工社保區別在于：
1、靈活就業社保是個人參保，需要個人進行繳納，而職工社保則是單位為員工參保，費用由單位和員工共同繳納，且單位出大頭，員工出小頭；
2、靈活就業社保只包含了醫療保險和養老保險，而職工社保則包含了醫療保險，養老保險，生育保險，失業保險，工傷保險；
3、靈活就業社保參保人員只要滿足一定條件，還能獲得靈活就業人員社保補貼等。
靈活就業繳納的社保和職工社保不同主要體現在以下幾點：
第一，險種不同，職工社保就是我們常說的五險，包含養老，工傷，失業，醫療和生育，近年來，醫療和生育已經合并，而靈活就業人員繳納的一般只有養老和醫療。大部分地區靈活就業者是無法參加生育和失業保險的，只有少數地區可以參加失業險。
另外單位就業的勞動者參加社保是強制性的，當單位沒有繳納社保的時候，勞動者可以依法維權，要求單位補繳社保。而靈活就業人員等群體是無法通過事后追補繳費的方式增加繳費年限的。
第二，繳費性質不同，根據《社保法》的規定，用人單位和勞動者必須參加社會保險，如果存在合法勞動關系但是單位沒有按照規定給員工繳納城鎮職工社保，那么屬于違法行為。而靈活就業者繳納社保沒有強制性，是自愿原則，靈活就業人員可自由選擇是否參保。
第三，繳費的主體不一樣，單位繳納社保，職工養老保險的單位繳費比例為繳費基數的16%，職工個人繳費比例為8%，也就是單位會承擔大部分費用，職工個人只需要承擔一小部分，而靈活就業人員自己繳納社保，需要自己負擔全部費用，相對來說，靈活就業繳納的負擔會重一點。
第四，繳費的基數不一樣，單位交社保，繳費基數是根據職工本人上年度的平均工資計算的，而自己以靈活就業人員身份交社保，可以根據自身實際情況選擇適合自己的繳費基數，繳費基數范圍通常為當地上年度社會平均工資的60%-300%。
第五，待遇政策不一樣，靈活就業人員參加社保和職工參加社保在待遇上會有一點區別，比如說，就業困難人員社會保險補貼，單位招聘就業困難人員，相應的補貼是發給公司的，而靈活就業人員就是補給個人的，而去兩者的比例也是不同的。
第六，退休的時間不一樣，按照現在退休時間規定，單位繳納社保，男性60周歲退休，女工人50周歲退休，女干部55周歲退休，靈活就業者自己繳納社保，男性60周歲退休，女性55周歲退休，當然也有部分地區允許女性靈活就業者50周歲退休，具體以當地政策為準。
法律依據
《中華人民共和國社會保險法》
第四條　中華人民共和國境內的用人單位和個人依法繳納社會保險費，有權查詢繳費記錄、個人權益記錄，要求社會保險經辦機構提供社會保險咨詢等相關服務。
個人依法享受社會保險待遇，有權監督本單位為其繳費情況。

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