首先，大宗交易是通過交易所的大宗交易平臺進行的，手續便捷。而協議轉讓，交易所須對雙方資格、交易文件和交易內容進行個案審查，程序嚴格，速度遲緩。

其次，涉及出讓方是大股東時，二者區別尤為關鍵，協議轉讓份額不得低于5%，受讓方受讓后仍須受到大股東減持規定限制，后續無法快速出手。而大宗交易只要控制在5%下，后手出讓，便捷多多。

事實上，二者皆為大股東減持主要手段，只是大宗交易較為多用。實踐中，二者可結合使用。

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