樓主在選擇Y subcoclumns for replicates or error bars 下的第三個(gè)enter and plot error values already calculated elsewhere ,enter中選擇mean,SD,N即可
QPCR實(shí)驗(yàn)得到了相關(guān)的數(shù)據(jù)可以利用GraphPad Prism軟件分析QPCR數(shù)據(jù),這是一個(gè)十分好的辦法。
方法
下載安裝GraphPad Prism軟件。
選擇Y subcoclumns for replicates or error bars 下的第三個(gè)enter and plot error values already calculated elsewhere ,enter中選擇mean,SD,N即可 1. 首先把你的數(shù)據(jù)在Excel 中按以下方式排列: 第一列, 藥物濃度要換算成log值, 第二列, 與第
在電腦上打開(kāi)GraphPad Prism軟件,會(huì)彈出對(duì)話框welcome to GraphPad Prism,點(diǎn)擊左邊的Column,選擇右邊的choose a graph第一排的第四個(gè)柱形圖。然后點(diǎn)擊右下角的Create。
graphpad prism 6是最新版的醫(yī)學(xué)繪圖統(tǒng)計(jì)軟件,一般搜索因上都有g(shù)raphpad prism 5,如果想體驗(yàn)新功能的不防試試graphpad prism 6。 graphpad prism 6基于生物統(tǒng)計(jì),曲線擬合和科學(xué)繪圖于一體,可以制作出非常專業(yè)的醫(yī)學(xué)表。
接著你在ABCD等等那一排的下面的空白框中輸入你的實(shí)驗(yàn)分組報(bào)告(比如Control,Sample組之類的,以Control組和EAE組為例)。
有些軟件是可以代替的,這個(gè)好象沒(méi)有百度搜索Graphpad prism7.0軟件下載,彈出如下網(wǎng)頁(yè)。選擇第一條,點(diǎn)擊進(jìn)點(diǎn)擊如下鏈接下載下載完畢,得到如圖所示壓縮包,解壓縮開(kāi)始準(zhǔn)備安裝。 點(diǎn)擊prism應(yīng)用程序,開(kāi)始安裝軟件在serial number那一欄輸入如
往實(shí)驗(yàn)分組對(duì)應(yīng)的下方添加你的QPCR實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。點(diǎn)擊Graphs底下的Data-1。會(huì)彈出你的實(shí)驗(yàn)結(jié)果柱狀圖。
GraphPad Prism 5 怎樣在圖表中加入標(biāo)準(zhǔn)差 2010-11-30 19:35 eardo | 分類:常見(jiàn) 如題。最好是能做成 ±xx 這種形式的標(biāo)準(zhǔn)差
將X-title刪掉,Y-title改成QPCR的Relative Expression,把Data-1改成你設(shè)計(jì)的引物,比如occludin。
這種情況需要再多列出一列frequency 填上死亡數(shù)目,然后選擇數(shù)據(jù)-加權(quán)-將frequency加權(quán)
點(diǎn)擊左上方Analysis下面的Analyze。會(huì)彈出Analyze Data的對(duì)話框。將Column analyses下面改成t test(and nonparametric tests),點(diǎn)擊OK出現(xiàn)新對(duì)話框,再點(diǎn)擊OK,出現(xiàn)新對(duì)話框,上面顯示p value summary為三顆星。
兩組連續(xù)變量的比較是臨床科研中經(jīng)常遇見(jiàn)的問(wèn)題,比如比較試驗(yàn)組和對(duì)照組的年齡是否相同。對(duì)于此類數(shù)據(jù)的分析,首先應(yīng)看再試驗(yàn)設(shè)計(jì)上是否進(jìn)行了配對(duì),之后再看數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布,方差是否齊。對(duì)于此類數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù),大致可以遵循圖1所示的原則。
返回屬性圖數(shù)據(jù)。點(diǎn)擊左邊的Graphs下面的Data 1,點(diǎn)擊最上面的Draw下面橫線,選擇橫線,點(diǎn)擊Write下面的黑體字T,在橫線上面標(biāo)記星號(hào)或者ns即可。就返回了屬性圖數(shù)據(jù)。
Standard Error of Mean 標(biāo)準(zhǔn)誤,即樣本均數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)差,是描述均數(shù)抽樣分布的離散程度及衡量均數(shù)抽樣誤差大小的尺度,反映的是樣本均數(shù)之間的變異。標(biāo)準(zhǔn)誤不是標(biāo)準(zhǔn)差,是多個(gè)樣本平均數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)差。 標(biāo)準(zhǔn)誤用來(lái)衡量抽樣誤差。
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怎樣應(yīng)用graphpad prism5統(tǒng)計(jì)兩組數(shù)據(jù)
Standard Error of Mean 標(biāo)準(zhǔn)誤,即樣本均數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)差,是描述均數(shù)抽樣分布的離散程度及衡量均數(shù)抽樣誤差大小的尺度,反映的是樣本均數(shù)之間的變異。標(biāo)準(zhǔn)誤不是標(biāo)準(zhǔn)差,是多個(gè)樣本平均數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)差。 標(biāo)準(zhǔn)誤用來(lái)衡量抽樣誤差。
graphpad prism分析WB條帶
打開(kāi)Image J軟件導(dǎo)入WB條帶圖片:File→Open→找到WB條帶把圖片轉(zhuǎn)化成灰度圖片:Image→Type→8-bit。消除圖片背景的影響:Process→Subtract Background,在彈出的對(duì)話框中,填上50基本就可以了,并勾上Lightbackground,點(diǎn)擊OK。此時(shí)圖片背景會(huì)變白一些。設(shè)置定量參數(shù):Analyze→Set Measurements。在彈出的對(duì)話框中勾選Area、Mean grayvalue、Min& max gray value、Integrated density。設(shè)置單位:Analyze→Set Scale。在彈出的對(duì)話框“Unit of length”后面填上“pixels”,其他的不用改動(dòng)。把WB圖片轉(zhuǎn)換成亮帶:Edit →Invert選擇菜單欄下的不規(guī)則圓形工具,將圓圈手動(dòng)拉倒第一條帶,并盡量將條帶都圈起來(lái)。點(diǎn)擊菜單欄Analyze下拉出現(xiàn)的measurement,即可彈出你選定區(qū)域的灰度統(tǒng)計(jì)值。也可以點(diǎn)擊快捷鍵英文狀態(tài)下的鍵盤m手動(dòng)移動(dòng)不規(guī)則圓圈至下一條條帶,重復(fù)8、9步驟,直至所有條帶都被測(cè)量當(dāng)測(cè)定完所有條帶,選結(jié)果中的“Edit”的“Select All”,然后復(fù)制數(shù)據(jù)“IntDen”到Excel表即可進(jìn)行分析。也可以直接在Results對(duì)話框中,選擇File →Saveas,直接導(dǎo)出excel表格在excel表格中將目的蛋白的灰度值除以內(nèi)參蛋白的灰度值,進(jìn)行歸一化處GraphpadPrism軟件中作柱狀圖。
如何使用graphpad做頻數(shù)分布圖
步驟 : 1. 打開(kāi) graphpad prism 5 ,出現(xiàn)以 下界面 2. 選擇 需要做的圖 : New table& graph 處選擇 XY ,Choose a graph 處選擇相應(yīng)的圖形(散點(diǎn)圖可選擇第一個(gè)或帶有連線的第二個(gè))在 在 Subcolumns for replicates or error values 處選擇(如果只有一個(gè) x 值對(duì)應(yīng)一個(gè) y 值,則選擇 Enter and plot a single Y value for each point ,如果有多個(gè) X 值對(duì)應(yīng)多個(gè) 個(gè) Y 值 (如同一濃度或同一時(shí)間點(diǎn)不同組別各個(gè)體的 Y 值) 則選擇圖中的圖標(biāo)) 3. 輸入數(shù)據(jù) (可參照下圖) 4. 查看圖形 點(diǎn)擊 graphs 中的 Data1 則出現(xiàn)以下圖形: 5. 對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,對(duì)圖形進(jìn)行擬合 XY 中可供選擇的分析種類有 選擇 上圖中中 工具欄中 Analyze data 選項(xiàng),GraphPad prism5 會(huì)自動(dòng)給出分析選項(xiàng),Linear regression 可給出 X、 、Y 值的相關(guān)性 r2。 。Nonlinear regression 分析時(shí),應(yīng)先對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行轉(zhuǎn)換( 可選擇 下圖中的 transform 選項(xiàng)) ,將 X 值轉(zhuǎn)換為對(duì)數(shù)格式后方可進(jìn)行 EC50 、IC50 的分析及曲線擬合。 柱狀圖作圖分析步驟: Grouped 作圖步驟: 雙因素(不同藥物不同時(shí)間點(diǎn)) 1. 打 開(kāi) graphpad prism 5 “ , 選 擇 “ Grouped ” ( 可 用 分 析 方 法 有) 2. 選擇相應(yīng)的圖形格式 一般選擇 下圖中的選項(xiàng)(可將實(shí)驗(yàn)中的諸如每組的濃度、反應(yīng)結(jié)果輸入) 3. 輸入數(shù)據(jù) 可選擇在列表頭輸入不同的治療方式或不同的藥物濃度題名,在行輸入不同時(shí)間點(diǎn)及不同時(shí)間點(diǎn)各組對(duì)應(yīng)的數(shù)值。 見(jiàn)下圖 4. 查看 GraphPad prism5 自動(dòng)生成的圖形按照下面截圖中 Graph 中與數(shù)據(jù)表相對(duì)應(yīng)的名稱(圖中為黑色粗體字) 即可查看 得到的圖形如下: 5. 對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,并在圖上進(jìn)行標(biāo)識(shí) 中 選擇下圖中工具欄中 Analyze 選項(xiàng),GraphPad prism5 會(huì)自動(dòng)給出分析選項(xiàng),擇 選擇 Two-way ANOVA 可比較實(shí)驗(yàn)結(jié)果在不同時(shí)間點(diǎn)、不同組別之間有無(wú)差別 ,選擇 Row means/totals, 可給出每個(gè)時(shí)間點(diǎn)每組的平均值,SEM 及 及 n 值。 6. 在圖形上添加相應(yīng)的字母、 圖標(biāo)或 或 word 、excel 表: 在柱形圖上右擊鼠標(biāo),選擇 insert text 可添加字母或符號(hào)如* ,選擇 insert object 可選擇相應(yīng)的選項(xiàng)添加 word 、excel 表。 Column 單因素柱狀圖 1. 打開(kāi) graphpad prism 5 ,選擇“Grouped ”(可用分析方法有 2. 選擇相應(yīng)的圖形格式 3. 輸入數(shù)據(jù) 4. 查看 GraphPad prism5 自動(dòng)生成的圖形按照下面截圖中 Graph 中與數(shù)據(jù)表相對(duì)應(yīng)的名稱(圖中為黑色粗體字)即可查看 得到圖形如下: 5. 對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析 選擇下圖中工具欄中 Analyze 選項(xiàng),GraphPad prism5 會(huì)自動(dòng)給出分析選項(xiàng),column 提供了正態(tài)分布檢驗(yàn)、t 檢驗(yàn)、單因素方差分析等分析選項(xiàng)
如何graphpad prism 分析生物數(shù)據(jù)
網(wǎng)上搜搜教程,很多的。如果看不會(huì),去小木蟲,丁香園上面提問(wèn)比這里靠譜多
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